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科研进展

“DNA compare software 1.0”获得国家版权局的计算机软件著作权授权登记

日期:2013-10-31 00:00      作者:     来源:     字体大小 [ ]

                     

日前,由淡水中心水产遗传育种研究室苏胜彦博士等人发明的“DNA compare software 1.0”获得国家版权局的计算机软件著作权授权登记,授权号:2013SR112380。
    本平台通过构建MySQL数据库和依据Smith Waterman 算法进行序列比对,开发了DNAcomparisons1.0,开发语言使用JAVA,源代码可在Windows,Unix和Linux上使用。根据使用者的需要,可依据相似度分值进行排序和选择,对输入的待检测序列可以选择一条或是多条,对输出结果的多少也可进行数量的选择,并提供如果待检测序列是新品种序列的话,可根据入库的编码要求,进行登记入库。入库序列采用FASTA格式。同时该库具有按照条形码种质鉴定的要求使序列标准化的功能。

(水产遗传育种研究室 供稿)